Genome Divergence in Progress - a population genetic analysis of the allopolyploid Arabidopsis suecica and its maternal parent A. thaliana

Detta är en avhandling från Mattias Jakobsson, Dept. of COB, Genetics, Lund University

Författare: Mattias Jakobsson; Lunds Universitet.; Lund University.; [2005]

Nyckelord: NATURVETENSKAP; NATURAL SCIENCES; cytogenetik; Genetik; cytogenetics; Genetics; sequence polymorphism; microsatellites; population structure; polyploidy; single origin; Arabidopsis thaliana; Arabidopsis suecica; genome evolution; evolutionary history; Plant genetics; Växtgenetik;

Sammanfattning: Popular Abstract in Swedish Den evolutionära historia hos allotetraploida växten Arabidopsis suecica och dess maternella förälder A. thaliana studerades från ett populationsgenetiskt perspektiv. Båda arterna innehåller varsitt thaliana-genom vilka är separerade från varandra, dvs inget genflöde förekommer mellan arterna. Metoder för att dra slutsattser om polyploiders evolutionära historia utvecklades och tillämpades på polymorfidata från de båda arterna. Evolutionära och demografiska hypoteser undersöktes med hjälp av sekvens- och mikrosatellit-variation från både kärngenomet och kloroplastgenomet. Till skillnad från traditionell artbildning så är artbildning via polyploidisering en process bestående av väldefinierade diskreta händelser. Det visade sig att A. suecica endast har uppkommit en gång, arten har alltså ett singulärt ursprung som uppskattades till att vara mellan 10 och 65 tusen år sedan. Den första populationsgenetiska helgenom studien av en eukaryot organism (A. thaliana) presenteras och den visar att observerade data inte följer vad som förväntas enligt populationsgenetiska neutrala modeller. Slutligen studerades mikrosatelliters generella evolutionsprinciper med fokus på kloroplastgenomet hos A. thaliana.

  KLICKA HÄR FÖR ATT SE AVHANDLINGEN I FULLTEXT. (PDF-format)